Честотата на хипербарната кислородна терапия трябва да се спазва стриктно, както е предписано от лекаря, обикновено веднъж на ден за 90-120 минути всеки път. Специфичният режим трябва да се коригира въз основа на състоянието на пациента, целите на лечението и толерантността. При специални обстоятелства може временно да се увеличи до два пъти на ден (напр. при остро отравяне с въглероден окис), но това трябва да бъде решено от лекар след оценка на риска.
Един път дневно е обичайният режим.
Повечето заболявания (като хронично зарастване на рани, внезапна глухота, радиационно увреждане и др.) използват веднъж-дневна хипербарна кислородна терапия. Всяко лечение включва херметизация, вдишване на стабилен кислород и фази на декомпресия с обща продължителност приблизително 90-120 минути.
Тази честота гарантира ефикасност, като същевременно избягва страничните ефекти, които могат да бъдат причинени от чести лечения (като баротравма на средното ухо, риск от кислородна токсичност).
Курсът на лечение е свързан-с болестта.
Остри състояния (напр. отравяне с въглероден окис): обикновено изискват 3-5 последователни дни лечение.
Хронични заболявания (напр. диабетни язви на краката): може да изискват 20-40 процедури, които продължават няколко седмици.
Неврологични рехабилитационни заболявания (напр. последствия от пост-травматично мозъчно увреждане): може да изискват дългосрочно-интермитентно лечение.
